ClusterFY pretende mejorar los instrumentos políticos regionales y nacionales buscando la intensificación de los procesos de formación de clusters relacionados con las Tecnologías Facilitadoras Esenciales (KET, de sus siglas en inglés), así como fomentar la cooperación interregional entre clusters y redes empresariales. La integración de estas organizaciones en cadenas de valor innovadoras es también objetivo prioritario de ClusterFY. Estos procesos potencian la implementación de estrategias regionales de innovación.